Kariotypowanie to proces porządkowania i łączenia wszystkich chromosomów znajdujących się w organizmie w celu uzyskania całościowego widoku całej „mapy” chromosomów danej osoby.
Ale najpierw upewnijmy się, że rozumiemy, jakie chromosomy są na pierwszym miejscu. Chromosomy są strukturami, które wyglądają podobnie do nici zawartych w jądrze każdej komórki twojego ciała.
Każda struktura chromosomu zawiera cały plan informacji genetycznej twojego ciała. To dyktuje strukturę twojego ciała, reaguje na bodźce, predyspozycje do chorób itp. Kobiety mają 2 chromosomy „X”, a mężczyźni mają jeden chromosom „X” i jeden „Y”. Każda komórka twojego ciała zawiera 23 pary chromosomów, w sumie 46 chromosomów.
Aby naukowcy mogli zrozumieć sekwencje chromosomów każdego pacjenta, używają oprogramowania do kariotypowania . Ten typ oprogramowania jest przeznaczony do przeprowadzania analizy chromosomów i ocenia strukturę i liczbę chromosomów danej osoby. W ten sposób naukowcy i naukowcy mogą wykryć nieprawidłowości.
W tym artykule omówimy kilka wspaniałych opcji oprogramowania, które umożliwiają wykonanie analizy kariotypowania.
- 1
ArgusSoft
ArgusSoft to świetna opcja oprogramowania, która pozwala na automatyczne kariotypowanie chromosomów ludzkich według pozycji pasma, a także może być używana do kariotypowania zwierząt i chromosomów roślin w trybie online.
Kluczowe cechy:
- Barwienie G, Q, R
- Zautomatyzowane kariotypowanie ludzkich chromosomów z rozpoznaniem zgięć
- Automatyczne kariotypowanie chromosomów świń
- 3 wbudowane podstawy standardowych ideogramów ludzkich chromosomów o różnych poziomach czystości - 400, 550 i 850 poziomów
- Może dodawać podstawy standardowych ideogramów cromosome dla innych gatunków zwierząt i roślin
- Metody przygotowywania próbek
- Wprowadzanie obrazów płyt metafazowych za pomocą kamery i skanera
- Towarzyszenie obrazowi z grafiką
- Zautomatyzowany podział zastosowanych i stykających się chromosomów
- Porównanie chromosomów i ideogramów
Możesz także użyć ArgusSoft do szkolenia systemu rozpoznawania chromosomów za pomocą wcześniej przygotowanych preparatów, przenosić obrazy płytek metafazowych i kariogramy do wbudowanej bazy danych, tworzyć wzory raportów, poprawne kariogramy, a także przechowywać i drukować obrazy i wyniki analiz.
Możesz uzyskać szkolenie i pomoc w korzystaniu z ArgusSoft ze swojej oficjalnej strony internetowej. Centrum wsparcia obejmuje usługi szkoleniowe, konserwacyjne i konsultacyjne.
Wypróbuj ArgusSoft
- 2
HiBand by Applied Spectral Imaging
HiBand to oprogramowanie stworzone przez Applied Spectral Imaging, które może przeprowadzać zaawansowaną analizę chromosomów za pomocą cyfrowych cech kariotypowania. To oprogramowanie
wykorzystuje zautomatyzowane funkcje skanowania do dogłębnej analizy struktury chromosomów.
Możesz korzystać z szerokiej gamy funkcji HiBand do indeksowania, liczenia, przechowywania i zarządzania danymi wyników. Możesz także użyć tego potężnego oprogramowania do automatycznego skanowania sekwencji chromosomów.
Wyniki uzyskane przy użyciu znalezionych funkcji kariotypowania HiBand można przechowywać w bezpiecznym miejscu za pomocą chronionych hasłem i zaszyfrowanych warstw. Pozwala to na spokój w przypadku utraty ważnych danych sekwencyjnych, a co za tym idzie, zwiększa wydajność laboratorium.
Sortowanie wyników odbywa się w bardzo prosty sposób, wystarczy poszukać konkretnej sekwencji chromosomów, a wszystkie wyniki są wyświetlane na dobrze zamkniętym ekranie, który zapewnia łatwy dostęp do modyfikacji, przeglądania i dodawania tagów do dowolnego plików.
Kluczowe cechy:
- Brightfield Karyotyping-G-Band i R-Band
- Fluorescencyjne kariotypowanie-Q-Band, R-Band i FISH
- Spektralne kariotypowanie
- Automatyczne zliczanie chromosomów
- Indeksowanie i klasyfikacja chromosomów
- Zaawansowana separacja chromosomów i zaawansowane ulepszanie obrazu
- Galeria zdjęć - może prezentować wszystkie metafazy przypadku i kariotypy na jednym ekranie
- Potrafi porównać chromosomy - zobacz je obok siebie
- Abberant Ideogram - możesz dodać chromosomy, komórki, ideogramy i adnotacje w generatorze obrazu
HiBand wykorzystuje w pełni zautomatyzowane przepływy pracy w celu zwiększenia wydajności laboratorium, posiada funkcje skanowania „start-and-walk-away”, znajduje metafazy, automatycznie odczytuje kody kreskowe, przesyła obrazy w czasie rzeczywistym podczas skanowania slajdów, a także eksportuje do laboratorium LIS Central Portal i Baza danych.
Wypróbuj HiBand
- 3
Ikaros od MetaSystems
Ten system kariotypowania ma bardzo intuicyjny interfejs użytkownika, który oferuje wszystkie funkcje na jednym ekranie. Pozwala to na łatwy i szybki dostęp do wszystkich uzyskanych informacji.
Ikaros może być używany z Neon, który jest platformą zaprojektowaną do pomocy w danych obrazu i organizacji sprawy. Neon zbiera dane ze wszystkich zadań obrazowania, źródeł zewnętrznych i umożliwia prezentację ich w łatwy do zrozumienia sposób za pomocą pulpitu zarządzania sprawami.
To narzędzie pozwala zawsze mieć pod ręką ważne informacje i przechowywać je w bezpieczny sposób, ale wykorzystuje bardzo silne algorytmy zarządzania danymi, ma szeroki zakres sposobów obserwacji danych i może zapewnić konkretne wyszukiwania na podstawie słów kluczowych i charakterystyk danych.
Sprawdź więcej informacji na temat Neon i jego funkcji tutaj .
Ikaros obsługuje wiele różnych technik bandowania - pasmo G w paśmie jasnym i pasmo R, pasmo Q fluorescencji, pasmo R i FISH - oferuje dużą liczbę wstępnie zdefiniowanych kariogramów dla ludzi, roślin i zwierząt. Możesz łatwo edytować te formularze, aby dodać dowolne dane wymagane do rodzaju prowadzonych badań.
Fakt, że można porównywać chromosomy według klas lub kariogramów, oferuje bardzo przydatne informacje, które pozwalają łatwo zidentyfikować różnice.
Wypróbuj Ikaros
- 4
MetaClass według Microptic
MetaClass to świetne oprogramowanie kariotyopujące zaprojektowane w sposób modułowy. To oprogramowanie pomaga przeprowadzać badania kariotypowania i FISH chromosomów.
MetaClass składa się z następujących modułów:
- Baza danych MetaClass
Baza danych, którą można zainstalować z dowolnym modułem MetaClass. Umożliwia przechowywanie danych pacjenta i zapewnia łatwy dostęp do wyników. Za pomocą tego modułu można tworzyć niestandardowe raporty w dowolnym języku.
- MetaClassing Karyotyping
Pozwala na badanie kariotypu po cyfrowym uchwyceniu obrazów etapu przygotowania metafazy i uporządkowaniu ich w pary w oparciu o rozmiar, pozycję itp. Moduł ten zapewnia doskonałe wyniki jakościowe w odniesieniu do pasm chromosomów, a także może dostarczaj profesjonalnie wyglądających raportów.
Najważniejsze funkcje:
- Badanie kariotypu analizuje się w powiększeniu 100X w jasnym polu
- Może przechwytywać kilka obrazów metafazy
- Jakość obrazu jest modyfikowalna w celu uzyskania wyraźniejszych wyników
- Automatyczna klasyfikacja chromosomów
- 4 widoki ekranu - okno Metaphase, Karyotype i Unclassified chromosomes
- Może wyświetlać prototypy chromosomów
- Chromosomy, które nie są sklasyfikowane, mogą być automatycznie lub ręcznie korygowane - superpozycje, separacje, skrzyżowania, obroty itp.
- Pliki sesji MTC lub obrazy BMP można zapisać i ponownie załadować w dowolnym momencie
- Może eksportować pojedyncze chromosomy do bazy danych Metaclass z możliwością dodawania komentarzy i notatek
Oto przykład raportu kariotypowania Metaclass.
- MetaClass FISH
Jest to moduł analizy, który pozwala uzyskać obraz hybrydyzacji Fluorescent IN SITU (FISH). Moduł ten rejestruje obrazy za pomocą fluorescencyjnych sond DNA i pozwala potwierdzić nieprawidłowości genetyczne - trisomie, mocrodelekcje, przegrupowania chromosomów itp.
Obrazy FISH są analizowane w powiększeniu 100X, a dla szerszego zakresu klarowności obrazu można także przechwytywać obrazy z różnymi filtrami.
Jeśli chcesz dowiedzieć się więcej na temat modułów przedstawionych powyżej i innych funkcji, możesz przejrzeć katalog MetaClass.
Jeśli jesteś ciekawy i chcesz zobaczyć raport uzyskany za pomocą metody FISH, możesz
przykładowy plik PDF.Wypróbuj MetaClass
- 5
GenASis Bandview
GenASis Bandview to kolejne wspaniałe oprogramowanie do kariotypowania zbudowane z modułów o różnych właściwościach. Możesz użyć tej aplikacji do przeprowadzenia diagnostyki kariotypowania i uzyskania dokładnych wyników testów.
To oprogramowanie pozwala w pełni dostosować przepływ pracy i proces diagnozy, w zależności od potrzeb firmy i celów, które próbujesz osiągnąć.
Szeroka gama narzędzi dostępnych w BandView jest łatwo dostępna za pomocą jednego kliknięcia myszą i oferuje potężne doświadczenie w kariotypowaniu G / R / C / Q-Band. Możesz wybrać między automatycznym lub ręcznym przepływem pracy, jeśli chodzi o lokalizowanie metafaz i przechwytywanie obrazów.
Nieprawidłowości chromosomowe, jeśli zostaną znalezione, można zaobserwować poprzez dodanie, delecję lub przegrupowanie materiału genetycznego pacjenta. Z BandView możesz użyć pasma techniki molekularnej FISH.
FISH używa sond fluorescencyjnych do przyłączania się do różnych części chromosomu, umożliwiając oprogramowaniu wykrycie i zlokalizowanie nieprawidłowości występujących w określonych sekwencjach DNA.
Wypróbuj przeglądarka GenASis
Wniosek
W tym artykule zbadaliśmy jedne z najlepszych zautomatyzowanych programów do kariotypowania, które istnieją na rynku pod koniec 2018 roku.
Opcje oprogramowania do kariotypowania opisane w tym artykule oferują szereg funkcji, które pomogą Ci osiągnąć cele firmy.
Korzystając z tego typu oprogramowania, można szybko policzyć tysiące struktur chromosomów, przeanalizować je przy użyciu różnych profesjonalnych technik i opracować wysokiej jakości raporty, które pozwolą z łatwością zidentyfikować wszelkie nieprawidłowości.
Chcielibyśmy dowiedzieć się, jaka jest twoja opinia na temat oprogramowania, które przedstawiliśmy na liście 5 najlepszych. Daj nam znać, korzystając z poniższej sekcji komentarzy.
POWIĄZANE PROWADZENIA, KTÓRE NALEŻY SPRAWDZIĆ:
- Potrzebujesz oprogramowania ankietowego do badań naukowych? Oto 5 narzędzi
- 5 najlepszych programów do pisania akademickiego
- 10 najlepszych programów do plagiatu do wykrywania zawartości kopii w 2019 roku
